提高合成蛋白质稳定性的系统和方法
技术特征:
1.一种蓝色荧光蛋白(bfp)变体,其包含氨基酸序列,相对于seq id no:1,所述氨基酸序列包含一个或多个突变,所述一个或多个突变选自:s28a、y96f、s114t、和n173h。
2.如权利要求1所述的bfp变体,其中所述一个或多个突变还包含t127l。
3.如权利要求1所述的bfp变体,其中所述一个或多个突变包含s28a和s114t。
4.如权利要求1所述的bfp变体,其中所述一个或多个突变包含s28a、s114t和n173h。
5.如权利要求1所述的bfp变体,其中所述一个或多个突变包含s28a、s114t、n173h和y96f。
6.如权利要求2所述的bfp变体,其中所述一个或多个突变包含s28a、s114t、n173h和t127l。
7.如权利要求2所述的bfp变体,其中所述一个或多个突变包含s28a、s114t、n173h,t127l和y96f。
8.如权利要求1所述的bfp变体,其中所述氨基酸序列由seq id no:25组成。
9.如权利要求1所述的bfp变体,其中所述氨基酸序列由seq id no:26组成。
10.如权利要求1所述的bfp变体,其中所述氨基酸序列由seq id no:27组成。
11.如权利要求2所述的bfp变体,其中所述氨基酸序列由seq id no:24组成。
12.如权利要求2所述的bfp变体,其中所述氨基酸序列由seq id no:28组成。
13.一种融合蛋白,其包含氨基酸序列,所述氨基酸序列包含seq id nos:24-28中的任一项。
14.一种蛋白质片段,其包含氨基酸序列,所述氨基酸序列包含seq id nos:24-28中的任一项。
15.一种核酸分子,其包含核苷酸序列,所述核苷酸序列编码权利要求1或2所述的bfp变体。
16.如权利要求15所述的核酸分子,其中所述核酸分子是质粒或表达载体。
17.一种试剂盒,其包含如权利要求16所述的核酸分子。
技术总结
一种训练神经网络以改良蛋白质特性的计算机执行方法,包括从数据库收集一组氨基酸序列,将每个氨基酸序列编译成折叠蛋白质的三维晶体结构,用所述三维晶体结构的子集训练神经网络,用所述神经网络识别目标蛋白质中的待突变候选残基,并用所述神经网络识别要取代所述候选残基的预测氨基酸残基,以产生突变蛋白质,其中,所述突变蛋白质显示出比所述目标蛋白质在特性上的改良。还描述了用于改良蛋白质特性的系统。还描述了使用该系统生成的改良的蓝色荧光蛋白。
技术研发人员:安德鲁·埃灵顿,奥斯丁·科尔,拉格夫·什罗夫,罗丝·泰尔
受保护的技术使用者:德克萨斯大学董事会
技术研发日:
技术公布日:2024/12/10
技术研发人员:安德鲁·埃灵顿,奥斯丁·科尔,拉格夫·什罗夫,罗丝·泰尔
技术所有人:德克萨斯大学董事会
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