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基于XRCC3与XPC基因分析卵巢癌早期筛查方法与流程

2026-03-08 11:00:07 443次浏览

技术特征:

1.基于xrcc3与xpc基因分析卵巢癌早期筛查方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于xrcc3与xpc基因分析卵巢癌早期筛查方法,其特征在于,所述步骤三中,所述mrna的逆转录反应采用cbcscript逆转录酶,以保证逆转录效率和cdna的完整性,通过将从实验组-临床卵巢癌患者和对照组-其他良性疾病就诊患者收集的mrna混合,并根据cbcscript逆转录酶的用户手册中提供的反应条件设置,包括适宜的温度和时间,在反应完成后,利用琼脂糖凝胶电泳法确认cdna的质量,通过比较cdna的条带大小与标准标记,以验证完整性。

3.根据权利要求1所述的基于xrcc3与xpc基因分析卵巢癌早期筛查方法,其特征在于,所述步骤四中,加入全基因组扩增试剂的浓度范围为1-5μl,并保持反应体系的体积在20-50μl,在扩增过程中采用热循环程序,包括以下阶段:

4.根据权利要求1所述的基于xrcc3与xpc基因分析卵巢癌早期筛查方法,其特征在于,所述步骤五中,片段化后的dna样本需经过酶解处理,其酶的选择包括限制性内切酶或dna片段化酶,生成的dna片段在200-500bp范围内,在dna沉淀后,通过离心和洗涤去除未结合的试剂和酶,得到高纯度的片段化dna样本,并重悬于适当的杂交缓冲液中。

5.根据权利要求1所述的基于xrcc3与xpc基因分析卵巢癌早期筛查方法,其特征在于,所述步骤六中,片段化后的dna样本经过变性处理,使其转变为单链形式,此时,dna样本中的序列与芯片上位点特异的50个碱基探针进行退火结合,每个微珠bead上连接着不同的50个碱基序列。

6.根据权利要求1所述的基于xrcc3与xpc基因分析卵巢癌早期筛查方法,其特征在于,所述步骤七中,将芯片放入xc4试剂中进行包被,使芯片的表面包裹上一层粘性透明液体,在芯片外形成保护层。

7.根据权利要求1所述的基于xrcc3与xpc基因分析卵巢癌早期筛查方法,其特征在于,所述步骤八中,将经过杂交和延伸反应处理的芯片放入扫描仪中,通过激光激发芯片上单碱基延伸产物的荧光基团,扫描仪获取由荧光基团发出的荧光信号,并生成高分辨率的图像数据,所得的图像数据直接导入luxscan3.0图像分析软件处理与分析,提取每个样本的snp分型数据。

8.根据权利要求1所述的基于xrcc3与xpc基因分析卵巢癌早期筛查方法,其特征在于,所述步骤九中,根据目标基因的序列信息设计特异性引物,引物的tm值相近,在在rt-pcr反应中,设定初始变性温度为95℃,退火温度为60℃,延伸温度为72℃,每个循环设定为30秒,pcr产物通过琼脂糖凝胶电泳分离,确认扩增的特异性和大小,通过比较扩增产物的条带强度及位置,确认上调和下调基因的表达差异。


技术总结
本发明公开基于XRCC3与XPC基因分析卵巢癌早期筛查方法,在通过识别基因多态性为卵巢癌的早期诊断提供新的生物标志物,该方法包括从临床卵巢癌患者和对照组收集外周血样本,提取全基因组DNA并进行纯化,随后,利用22K Human Genome Array芯片进行基因杂交,分析XRCC3和XPC基因的特定多态性位点,经过扩增、片段化和杂交后,使用激光扫描仪获取高分辨率的荧光图像,并通过图像分析软件评估基因表达差异,最终,通过RT‑PCR技术验证显著差异基因,通过XRCC3和XPC基因的特定多态性位点,有助于早期诊断卵巢癌。

技术研发人员:白延霞,赵成,胡艳,霍丹,闫莉
受保护的技术使用者:陕西省肿瘤医院(陕西省肿瘤防治研究所)(陕西省第三人民医院)
技术研发日:
技术公布日:2024/12/10
文档序号 : 【 40281798 】

技术研发人员:白延霞,赵成,胡艳,霍丹,闫莉
技术所有人:陕西省肿瘤医院(陕西省肿瘤防治研究所)(陕西省第三人民医院)

备 注:该技术已申请专利,仅供学习研究,如用于商业用途,请联系技术所有人。
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白延霞赵成胡艳霍丹闫莉陕西省肿瘤医院(陕西省肿瘤防治研究所)(陕西省第三人民医院)
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