一种影响鸡胫围的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用的制作方法

本发明属于鸡遗传育种和生物，特别涉及一种影响鸡胫围的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用。

背景技术：

1、胫围是蛋鸡选育常用指标，既可用来评价骨骼发育，也可用来衡量体尺均匀度。骨是蛋壳钙的主要供应源。据muir等统计，一只商品蛋鸡一生沉积在蛋壳中的钙约等于其体重。轻型蛋鸡，包括来航鸡和绿壳蛋鸡，临近产蛋末期往往面临骨质疏松的困扰，主要原因在于结构骨与髓质骨失去动态平衡，导致结构骨丧失完整性。骨质疏松危害蛋鸡生产主要体现在三个方面：一是引起蛋鸡骨折、麻痹甚至死亡；二是产蛋性能下降；三是骨折及长期病痛导致的动物福利问题。为了减少骨质疏松对轻型高产蛋鸡的危害，需要改善蛋鸡骨骼质量，其中包括对胫围的选择。胫围性状由微效多基因调控，常规选育方法难以遗传上获取有效进展，唯有厘清胫围遗传结构，通过基因组选择提高其选育准确性，达到遗传上提升胫围尺寸的目的。

技术实现思路

1、为了满足蛋鸡行业对减轻骨质疏松危害的需要，选育胫围性状，本发明提供了一种影响鸡胫围的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，所述影响鸡胫围的snp遗传标记包括sc_tag4，该snp遗传标记有助于从遗传上提高胫围，将其应用于鸡的遗传育种，有利于改善蛋鸡胫围、减少骨质疏松发病频率，从而获得高品质蛋鸡品种。

2、本发明通过以下技术方案实现：

3、本发明提供一种影响鸡胫围的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，所述影响鸡胫围的snp遗传标记包括sc_tag4，所述sc_tag4对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体物理位置第75909527位，属于基因ldb2第8内含子序列，此处碱基为t或c。

4、基于同一发明构思，本发明提供一种鸡胫围性状的早期选择方法，所述早期选择方法包括基于snp遗传标记sc_tag4的基因型对鸡胫围性状进行早期选择；

5、所述sc_tag4对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体物理位置第75909527位，属于基因ldb2第8内含子序列，此处碱基为t或c。

6、进一步的，所述早期选择方法具体包括：

7、检测待测鸡基因组中sc_tag4遗传标记的基因型；

8、基于所述sc_tag4的基因型对待测鸡胫围性状进行早期选择；

9、其中，所述sc_tag4的tt基因型个体的胫围大于cc以及ct基因型个体的胫围。

10、进一步的，所述检测待测鸡基因组中sc_tag4遗传标记的基因型，具体包括：

11、以pr_sc4f和pr_sc4r为引物，对待测鸡的基因组dna进行pcr扩增；

12、对pcr扩增产物进行测序，获得待测鸡4号染色体正义链第75909527位的基因型；

13、其中，所述pr_sc4f的核苷酸序列如seq id no.1所示，所述pr_sc4r的核苷酸序列如seq id no.2所示。

14、优选的，所述待测鸡的品种包括东乡绿壳蛋鸡和/或白来航鸡。

15、基于同一发明构思，本发明提供用于检测snp遗传标记sc_tag4的引物，所述sc_tag4对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体物理位置第75909527位，属于基因ldb2第8内含子序列，此处碱基为t或c；

16、所述引物包括pr_sc4f和pr_sc4r，所述pr_sc4f的核苷酸序列如seq id no.1所示，所述pr_sc4r的核苷酸序列如seq id no.2所示。

17、基于同一发明构思，本发明提供用于检测snp遗传标记sc_tag4的引物在鸡遗传育种中的应用。

18、基于同一发明构思，本发明提供用于检测snp遗传标记sc_tag4的试剂盒，所述试剂盒包含上述用于检测snp遗传标记sc_tag4的引物。

19、基于同一发明构思，本发明提供用于检测snp遗传标记sc_tag4的试剂盒在鸡遗传育种中的应用。

20、基于同一发明构思，本发明还提供snp遗传标记sc_tag4在预测鸡40周龄胫围中的应用，所述sc_tag4对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体物理位置第75909527位，属于基因ldb2第8内含子序列，此处碱基为t或c。

21、本发明实施例中的一个或多个技术方案，至少具有如下技术效果或优点：

22、本发明一种影响鸡胫围的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，所述影响鸡胫围的snp遗传标记包括sc_tag4，sc_tag4的有益基因型(tt)个体的胫围更高，将其应用于鸡的遗传育种，有助于从遗传上提高蛋鸡40周龄胫围，进而获得腿部更强壮、体尺均匀度更好的蛋鸡，有利于减少骨质疏松发病频率，从而获得高品质蛋鸡品种。

1.一种影响鸡胫围的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，其特征在于，所述影响鸡胫围的snp遗传标记包括sc_tag4，所述sc_tag4对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体物理位置第75909527位，属于基因ldb2第8内含子序列，此处碱基为t或c。

2.一种鸡胫围性状的早期选择方法，其特征在于，所述早期选择方法包括基于snp遗传标记sc_tag4的基因型对鸡胫围性状进行早期选择；

3.根据权利要求2所述的一种鸡胫围性状的早期选择方法，其特征在于，所述早期选择方法具体包括：

4.根据权利要求3所述的一种鸡胫围性状的早期选择方法，其特征在于，所述检测待测鸡基因组中sc_tag4遗传标记的基因型，具体包括：

5.根据权利要求3或4所述的一种鸡胫围性状的早期选择方法，其特征在于，所述待测鸡的品种包括东乡绿壳蛋鸡和/或白来航鸡。

6.用于检测snp遗传标记sc_tag4的引物，其特征在于，所述sc_tag4对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal 1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体物理位置第75909527位，属于基因ldb2第8内含子序列，此处碱基为t或c；

7.如权利要求6所述的用于检测snp遗传标记sc_tag4的引物在鸡遗传育种中的应用。

8.用于检测snp遗传标记sc_tag4的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含权利要求6所述的用于检测snp遗传标记sc_tag4的引物。

9.如权利要求8所述的用于检测snp遗传标记sc_tag4的试剂盒在鸡遗传育种中的应用。

10.snp遗传标记sc_tag4在预测鸡40周龄胫围中的应用，其特征在于，所述sc_tag4对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal 1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体物理位置第75909527位，属于基因ldb2第8内含子序列，此处碱基为t或c。