玉米ZmER1基因在提高玉米穗腐病抗性中的应用的制作方法

1.一组与玉米穗腐病抗性显著相关的snp分子标记在玉米穗腐病抗性分子标记辅助选择或全基因组选择中的应用，其特征在于，所述snp分子标记包括snp1-snp50，其位于玉米的第1号染色体，具体信息如下：（1）碱基位置47833646的snp，类型为a/g；（2）碱基位置47833949的snp，类型为t/g；（3）碱基位置47834083的snp，类型为a/c；（4）碱基位置47834369的snp，类型为a/g；（5）碱基位置47834384的snp，类型为t/c；（6）碱基位置47834515的snp，类型为c/t；（7）碱基位置47834855的snp，类型为c/a；（8）碱基位置47834958的snp，类型为g/a；（9）碱基位置47835040的snp，类型为a/g；（10）碱基位置47835468的snp，类型为t/g；（11）碱基位置47835529的snp，类型为g/t；（12）碱基位置47835695的snp，类型为t/c；（13）碱基位置47835718的snp，类型为g/a；（14）碱基位置47835720的snp，类型为g/t；（15）碱基位置47835858的snp，类型为c/a；（16）碱基位置47835891的snp，类型为g/a；（17）碱基位置47835994的snp，类型为g/c；（18）碱基位置47836112的snp，类型为c/t；（19）碱基位置47836286的snp，类型为g/t；（20）碱基位置47836402的snp，类型为t/c；（21）碱基位置47836763的snp，类型为a/t；（22）碱基位置47836798的snp，类型为c/t；（23）碱基位置47836873的snp，类型为t/a；（24）碱基位置47837201的snp，类型为c/t；（25）碱基位置47854995的snp，类型为c/t；（26）碱基位置47924208的snp，类型为g/a；（27）碱基位置47926447的snp，类型为g/a；（28）碱基位置47926814的snp，类型为g/a；（29）碱基位置48033414的snp，类型为a/g；（30）碱基位置48033453的snp，类型为t/c；（31）碱基位置48033464的snp，类型为g/t；（32）碱基位置48034381的snp，类型为a/c；（33）碱基位置48034462的snp，类型为c/t；（34）碱基位置48034503的snp，类型为g/t；（35）碱基位置48034557的snp，类型为t/c；（36）碱基位置48034585的snp，类型为t/c；（37）碱基位置48034681的snp，类型为g/a；（38）碱基位置48039029的snp，类型为a/g；（39）碱基位置48072690的snp，类型为t/c；（40）碱基位置48074130的snp，类型为g/t；（41）碱基位置48180190的snp，类型为t/c；（42）碱基位置48272315的snp，类型为g/a；（43）碱基位置48338772的snp，类型为a/g；（44）碱基位置48369577的snp，类型为c/t；（45）碱基位置48372189的snp，类型为c/a；（46）碱基位置48389174的snp，类型为a/g；（47）碱基位置48389228的snp，类型为g/a；（48）碱基位置48392075的snp，类型为c/t；（49）碱基位置48392266的snp，类型为c/a；（50）碱基位置48395513的snp，类型为t/g；所述碱基位置是基于已测序玉米自交系b73基因组第5版本，即zm-b73-reference-nam-5.0。

2.zmer1基因在调控玉米穗腐病抗性中的应用，其特征在于，zmer1基因正调控玉米穗腐病抗性，在玉米中抑制zmer1基因的表达和/或活性，会导致玉米对穗腐病敏感，抗穗腐病能力下降；所述zmer1基因的核苷酸序列如seq id no:1所示，zmer1基因编码蛋白质的氨基酸序列如seq id no.2所示。

3.如权利要求 2所述的应用，其特征在于，所述zmer1基因的核苷酸序列包括 seq idno.1所示的核苷酸序列经取代一个或多个核苷酸且编码与seq id no.2相同或至少99％序列同一性氨基酸序列的核苷酸序列。

4.根据权利要求2所述的应用，抑制zmer1基因的方法包括基因编辑、rna干扰。

5.一种创制玉米穗腐病敏感突变体的方法，其特征在于，所述方法为权利要求4所述基因编辑方法，采用crispr/cas9基因编辑技术对zmer1基因进行定点突变，获得穗腐病敏感玉米突变体。

6.如权利要求5所述的方法，其特征在于，对玉米zmer1基因第3个外显子处设计crispr/cas9载体靶点mt1和mt2，所述靶点的dna序列如seq id no.3和seq id no.4所示。

7.利用权利要求6所述方法获得的zmer1突变基因zmer1-1和zmer1-2，其特征在于，zmer1-1突变位点在zmer1 cds 序列第433-613 bp碱基处删除181 bp碱基并插入66 bp碱基；zmer1-2突变位点在zmer1 cds 序列第435 bp处有1 bp碱基缺失和在599 bp处有1 bp碱基插入。