CCR8抗原结合单元及其用途的制作方法

本公开涉及基于抗体的治疗学领域。更具体地，本公开涉及抗-ccr8组合物和使用它们治疗疾病的方法。

背景技术：

1、尽管免疫疗法有望用于癌症治疗，但近80％的患者对检查点抑制剂(cpi)治疗没有反应。调节性t细胞(treg)通过多种抑制机制抑制肿瘤微环境中的免疫应答，已被认为在cpi疗效的缺乏中起关键作用。因此，靶向清除treg可促进更有效的抗肿瘤免疫。ccr8是一种趋化因子受体，其选择性地表达在活化的人的肿瘤内treg上，这些肿瘤内ccr8+treg已被证明可以驱动免疫抑制，从而导致不良预后。因此，ccr8可以通过选择性地耗尽肿瘤内免疫抑制treg细胞来作为癌症免疫疗法的靶点。靶向人ccr8的抗体可导致肿瘤中treg耗尽，并使肿瘤对cpi治疗如抗-pd-1治疗敏感。

技术实现思路

0、发明概述

1、本文公开了包含轻链互补决定区(cdr)(指轻链可变区)和重链cdr(指重链可变区)的抗原结合单元。在一些方面，抗原结合单元与ccr8结合，并防止ccr8与在免疫细胞表面表达的c-c基序趋化因子配体1(ccl1)结合。

2、在一些实施方案中，当抗原结合单元连接到可结晶片段(fc)区域时，特别是突变的fc变体，表现出增强的抗体依赖性细胞毒性(adcc)，从而杀死表达ccr8的treg细胞。

3、在一些实施方案中，抗原结合单元在翻译后修饰(ptm)位点包含至少一个突变。在一些实施方案中，所述至少一个突变是以下的至少一种：n28g突变、n28q突变、n28i突变、n28s突变、g29a突变、g29i突变和g29v突变。在一些实施方案中，所述突变是轻链cdr1中的n28g突变。

4、在一些实施方案中，重链cdr包含hc-cdr1、hc-cdr2和hc-cdr3，其中所述hc-cdr1、hc-cdr2和hc-cdr3各自包含与选自seq id no:13-15、19-22、71-73、77、78、81、83-85、89、91-93、97、98和112-118的序列具有至少60％、65％、70％、75％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列，包括具有这些值作为端点的任何范围(例如60％-85％)。

5、在一些实施方案中，重链cdr包含hc-cdr1、hc-cdr2和hc-cdr3，其中所述hc-cdr1、hc-cdr2和hc-cdr3各自包含选自以下的序列：seq id no:13-15、19-22、71-73、77、78、81、83-85、89、91-93、97、98和112-118。

6、在一些实施方案中，重链cdr包含hc-cdr1、hc-cdr2和hc-cdr3，其中所述hc-cdr1、hc-cdr2和hc-cdr3各自包含选自以下的序列：seq id no:13-15、19-22、89、114和115。

7、在一些实施方案中，重链cdr包含hc-cdr1、hc-cdr2和hc-cdr3，其中所述hc-cdr1、hc-cdr2和hc-cdr3各自包含选自以下的序列：seq id no:83-85和116-118。

8、在一些实施方案中，hc-cdr1包含选自以下的序列：seq id no:13、71、83、115和117，hc-cdr2包含选自以下的序列：seq id no:14、72、77、84、89、91、92、97、114、116和118，并且hc-cdr3包含选自以下的序列：seq id no:15、19-22、73、78、81、85、93、98、112和113。

9、在一些实施方案中，hc-cdr1包含选自以下的序列：seq id no:13和115，hc-cdr2包含选自以下的序列：seq id no:14、89和114，并且hc-cdr3包含选自以下的序列：seq idno:15和19-22。

10、在一些实施方案中，hc-cdr1包含选自以下的序列：seq id no:83和117，hc-cdr2包含选自以下的序列：seq id no:84、116和118，并且hc-cdr3包含seq id no:85的序列。

11、在一些实施方案中，轻链cdr包含lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3，其中所述lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3各自包含与选自seq id no:16-18、23、24、25、74-76、79、80、82、86-88、90、94-96和99-111的序列具有至少60％、65％、70％、75％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列，包括具有这些值作为端点的任何范围(例如60％-85％)。

12、在一些实施方案中，轻链cdr包含lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3，其中所述lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3各自包含选自以下的序列：seq id no:16-18、23、24、25、74-76、79、80、82、86-88、90、94-96和99-111。

13、在一些实施方案中，轻链cdr包含lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3，其中所述lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3各自包含选自以下的序列：seq id no:16-18、23、24、25、90和102-106。

14、在一些实施方案中，轻链cdr包含lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3，其中所述lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr2各自包含选自以下的序列：seq id no:86-88。

15、在一些实施方案中，lc-cdr1包含选自以下的序列：seq id no:16、74、79、86、90、94、99和102-109，lc-cdr2包含选自以下的序列：seq id no:17、75、80、87、95、100、110和111，并且lc-cdr3包含选自以下的序列：seq id no:18、23-25、76、82、88、96和101。

16、在一些实施方案中，lc-cdr1包含选自以下的序列：seq id no:16、90和102-106，lc-cdr2包含seq id no:17的序列，并且lc-cdr3包含选自以下的序列：seq id no:18和23-25。

17、在一些实施方案中，lc-cdr1包含seq id no:86的序列，lc-cdr2包含seq id no:87的序列，并且lc-cdr3包含seq id no:88的序列。

18、在一些实施方案中，重链cdr包含hc-cdr1、hc-cdr2和hc-cdr3，其中所述hc-cdr1、hc-cdr2和hc-cdr3分别包含选自下组的氨基酸序列：seq id no:13、seq id no:14和seqid no:15；seq id no:13、seq id no:14和seq id no:19；seq id no:13、seq id no:14和seq id no:20；seq id no:13、seq id no:14和seq id no:21；seq id no:13、seq id no:14和seq id no:22；seq id no:71、seq id no:72和seq id no:73；seq id no:71、seq idno:77和seq id no:78；seq id no:71、seq id no:72和seq id no:81；seq id no:83、seqid no:84和seq id no:85；seq id no:13、seq id no:89和seq id no:15；seq id no:13、seq id no:91和seq id no:15；seq id no:71、seq id no:92和seq id no:93；seq id no:13、seq id no:97和seq id no:98；seq id no:13、seq id no:97和seq id no:112；seq idno:13、seq id no:97和seq id no:113；seq id no:13、seq id no:114和seq id no:15；seq id no:115、seq id no:114和seq id no:15；seq id no:83、seq id no:116和seq idno:85；seq id no:117、seq id no:116和seq id no:85；以及seq id no:83、seq id no:118和seq id no:85。

19、在一些实施方案中，轻链cdr包含lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3，其中所述lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3分别包括选自下组的氨基酸序列：seq id no:16、seq id no:17和seqid no:18；seq id no:16、seq id no:17和seq id no:23；seq id no:16、seq id no:17和seq id no:24；seq id no:16、seq id no:17和seq id no:25；seq id no:74、seq id no:75和seq id no:76；seq id no:79、seq id no:80和seq id no:76；seq id no:79、seq idno:75和seq id no:82；seq id no:86、seq id no:87和seq id no:88；seq id no:90、seqid no:17和seq id no:18；seq id no:94、seq id no:95和seq id no:96；seq id no:79、seq id no:75和seq id no:76；seq id no:99、seq id no:100和seq id no:101；seq idno:101、seq id no:17和seq id no:18；seq id no:103、seq id no:17和seq id no:18；seq id no:104、seq id no:17和seq id no:18；seq id no:105、seq id no:17和seq idno:18；seq id no:106、seq id no:17和seq id no:18；seq id no:107、seq id no:100和seq id no:101；seq id no:108、seq id no:100和seq id no:101；seq id no:109、seq idno:100和seq id no:101；以及seq id no:99、seq id no:111和seq id no:101。

20、在一些实施方案中，重链cdr包含hc-cdr1、hc-cdr2和hc-cdr3，轻链cdr包含lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3，其中所述hc-cdr1、hc-cdr2、hc-cdr3、lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3分别包含选自下组的氨基酸序列：seq id no:13、14、15、16、17和18；seq id no:13、14、19、16、17和18、seq id no:13、14、20、16、17和18；seq id no:13、14、21、16、17和18；seqid no:13、14、22、16、17和18；seq id no:13、14、15、16、17和23；seq id no:13、14、15、16、17和24；seq id no:13、14、15、16、17和25；seq id no:13、14、19、16、17和23；seq id no:13、14、20、16、17和23；seq id no:13、14、21、16、17和23；seq id no:13、14、22、16、17和23；seq id no:13、89、15、90、17和18；seq id no:13、89、15、102、17和18；seq id no:13、89、15、103、17和18；seq id no:13、89、15、104、17和18；seq id no:13、89、15、16、17和18；seqid no:13、89、15、105、17和18；seq id no:13、89、15、106、17和18；seq id no:13、114、15、16、17和18；以及seq id no:115、114、15、16、17和18。

21、在一些实施方案中，重链cdr包含hc-cdr1、hc-cdr2和hc-cdr3，轻链cdr包含lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3，其中所述hc-cdr1、hc-cdr2、hc-cdr3、lc-cdr1、lc-cdr2和lc-cdr3分别包括选自下组的氨基酸序列：seq id no:83、84、85、86、87和88；seq id no:83、116、85、86、87和88；seq id no:117、116、85、86、87和88；以及seq id no:83、118、85、86、87和88。

22、在一些实施方案中，抗原结合单元包含重链cdr，其包含与选自seq id no:1、3、4、5、6、7、11、12、26、28、30、32、34、36、37、39、41、54-59、61和66-70的序列具有至少60％、65％、70％、75％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列，包括具有这些值作为端点的任何范围(例如60％-85％)。

23、在一些实施方案中，抗原结合单元包含重链cdr，其包含选自以下的序列：seq idno:1、3、4、5、6、7、11、12、26、28、30、32、34、36、37、39、41、54-59、61和66-70。

24、在一些实施方案中，抗原结合单元包括轻链cdr，其包含与选自seq id no:2、8、9、10、27、29、31、33、35、38、40、42-53、60和62-65的序列具有至少60％、65％、70％、75％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列，包括具有这些值作为端点的任何范围(例如60％-85％)。

25、在一些实施方案中，抗原结合单元包含轻链cdr，其包含选自以下的序列：seq idno:2、8、9、10、27、29、31、33、35、38、40、42-53、60和62-65。

26、在一些实施方案中，抗原结合单元包含重链cdr和轻链cdr，其中所述重链cdr和轻链cdr分别包含选自下组的氨基酸序列：seq id no:1和2；seq id no:3和2；seq id no:4和2；seq id no:5和2；seq id no:6和2；seq id no:7和2；seq id no:1和8；seq id no:1和9；seq id no:1和10；seq id no:3和8；seq id no:4和8；seq id no:5和8；seq id no:6和8；seq id no:11和8；seq id no:12和8；seq id no:34和35；seq id no:34和43；seq id no:34和44；seq id no:34和45；seq id no:34和46；seq id no:34和47；seq id no:34和48；seq id no:56和2；seq id no:57和2；seq id no:58和2；seq id no:59和2；seq id no:56和60；seq id no:57和60；seq id no:58和60；以及seq id no:58和60。在一些实施方案中，重链cdr和轻链cdr分别包含选自下组的氨基酸序列：seq id no:1和2；seq id no:3和2；seq id no:4和2；seq id no:5和2；seq id no:6和2；seq id no:7和2；seq id no:1和8；以及seq id no:1和9.

27、在一些实施方案中，抗原结合单元包含重链cdr和轻链cdr，其中所述重链cdr与轻链cdr分别包含选自下组的氨基酸序列：seq id no:32和33；seq id no:61和62；seq idno:61和63；seq id no:61和64；seq id no:61和65；seq id no:66和62；seq id no:67和62；seq id no:68和62；seq id no:69和62；以及seq id no:70和62。

28、在一些实施方案中，抗原结合单元包含igg1框架，在fc区具有或不具有突变。

29、在一些实施方案中，抗原结合单元是单克隆抗体、人源化抗体或嵌合抗体。在一些实施方案中，抗原结合单元是scfv、fab’、单链fab(scfab’)、fd或f(ab’)2、sfc、fv或ccfv。在一些实施方案中，抗原结合单元竞争与抗原结合单元识别的表位的结合。

30、在其他实施方案中，提供了包含本文公开的抗原结合单元中的任一种和药学上可接受的赋形剂的药物组合物。

31、在其他实施方案中，提供了编码本文公开的抗原结合单元中的任一种的分离的核酸。

32、在其他实施方案中，提供了包含编码本文公开的抗原结合单元中的任一种的核酸序列的载体。

33、在其他实施方案中，提供了表达本文公开的抗原结合单元中的任一种的宿主细胞。

34、在其他实施方案中，提供了包含编码本文公开的抗原结合单元中的任一种的核酸的宿主细胞。

35、在其他实施方案中，提供了制备本文公开的抗原结合单元中的任一种的方法。所述方法包括在适于表达抗原结合单元的条件下培养本文公开的任何宿主细胞；以及分离由宿主细胞表达的所述抗原结合单元。

36、在其他实施方案中，提供了消除免疫细胞群的方法。所述方法包括使免疫细胞与本文公开的任何抗原结合单元接触。在一些方面，免疫细胞是调节性t细胞(treg)。在其他实施方案中，免疫细胞是驻留在肿瘤中的treg。

37、在其他实施方案中，提供了治疗有需要的受试者的癌症的方法。所述方法包括向有需要的受试者施用有效量的本文所述的抗原结合单元。在实施方案中，所述方法包括重复施用步骤一段时间，诸如直到受试者没有癌症。在一些实施方案中，癌症是血液癌症或实体肿瘤。在一些实施方案中，治疗癌症包括减少肿瘤体积。

38、在其他实施方案中，提供了一种治疗有需要的受试者中的癌症的方法。所述方法包括向有需要的受试者施用有效量的药物组合物，所述药物组合物包含药学上可接受的赋形剂和本文公开的任何抗原结合单元。在一些实施方案中，所述方法包括重复施用步骤一段时间，诸如直到受试者没有癌症。在一些实施方案中，癌症是血液癌症或实体肿瘤。在一些实施方案中，治疗癌症包括减少肿瘤体积。