一种母猪畸形仔猪数相关的分子标记及其应用

本发明属于分子标记，具体涉及一种母猪畸形仔猪数相关的分子标记及其应用。

背景技术：

1、在养猪产业中，畸形仔猪的出现是一个不容忽视的问题，它不仅关系到仔猪的生存率和健康，还直接影响到养殖户的经济收益。从遗传选择到营养供给，再到环境管理，每一个环节的疏漏都可能导致畸形仔猪的发生。畸形仔猪对养殖生产的负面影响不容小觑：一是畸形仔猪由于存在生理缺陷，往往无法正常生长，甚至在出生后不久就会死亡，直接导致养殖户在仔猪上的投入无法获得回报，经济效益显著下降；二是畸形仔猪的出生会减少断奶仔猪的数量，并且母猪在生产畸形仔猪时，可能会经历更多的分娩并发症，影响其后续的繁殖能力从而影响母猪的繁殖性能；三是畸形仔猪的护理和处理也会消耗更多的时间和资源，进一步降低生产效率；四是畸形仔猪可能由于免疫系统不健全，更容易感染疾病，从而增加整个猪群的疾病传播风险，不仅影响仔猪的成活率，还可能对其他健康仔猪和母猪构成威胁，增加养殖成本和疾病防控难度。因此，需采取必要手段降低畸形仔猪数。

2、表型选择是传统的育种方法，主要依赖于直接观察和记录个体的表型特征。在猪的繁殖性状中，表型选择的效果受到遗传力的限制。例如，母猪的繁殖力性状如产仔数、健仔数等，虽然可以通过表型选择进行改良，但由于这些性状的遗传力较低(约0.1左右)，传统的表型选择方法效果有限。此外，表型选择需要大量的记录数据和较长的时间，才能准确估计育种值。分子标记辅助选择的出现，使得育种技术得到发展，可以通过识别与目标性状相关的基因或dna序列来辅助选择。这种方法在低遗传力性状的选择中显示出显著的优势，能够极大提高育种效率。此外，分子标记辅助选择(mas)在改良猪的繁殖性能方面也显示出潜力，例如通过选择与产仔数相关的基因，可以显著提高母猪的繁殖性能。此外，将具有大效应的分子标记整合进基因组选择，可以提高基因组预测的准确性。

3、当前研究表明，雌激素受体(esr)基因、促卵泡素β亚基(fshβ)基因、视黄酸受体γ基因(rarg)和视黄醇结合蛋白4基因(rbp4)等与猪产仔数有显著或较显著关联，这些基因被认为是控制猪产仔数的主效基因。但目前，畸形仔猪数的主效基因基因尚不明确。因此，寻找控制畸形仔猪数性状的关键分子遗传标记，并将其用于分子标记辅助选择育种或基于先验信息的基因组选择育种，对降低母猪的畸形仔猪数，增加经济效益具有重要意义。

4、在现代化养猪业中，畸形仔猪数仍然是影响母猪繁殖性能及整体养殖效益的一大因素。分子标记辅助选择虽然可以提高育种效率，但当前与畸形仔猪数相关的分子标记还较少。cn115478110a公开了与母猪产畸形仔猪性状相关的snp分子标记及其应用，利用基因芯片技术进行基因分型，基于snp分子标记进行全基因组关联分析，该分析筛选出4个与大白猪母猪产畸形仔猪性状相关的snp分子标记位点。

技术实现思路

1、开发一种专为猪设计、能够准确预测并有效降低畸形仔猪数的分子遗传标记，成为了当前养猪业遗传改良领域的迫切需求。本发明提供一种与畸形仔猪数高度相关、检测简便且成本效益高的分子遗传标记，通过遗传手段优化母猪繁殖性能，提升仔猪存活率，最终实现生猪产业的可持续发展。

2、具体技术方案如下：

3、一种与母猪畸形仔猪数相关的snp分子标记，所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no:1或2所示。

4、seq id no:1

5、tcctagccgctctggaccctcttcagcctttctctgattacctggtgcatattgattgcttttcctgaggacctagctaaggatttcagtaaaatgtgactttggggagatttctgtcctgtcccccttgggggtcagccttgacctcttcatgatccgggcagtgcaggtagagaggagaagagtgtgtgtgtgtgggggggggagtgtgggtgtgggtgtgttagtggtggtgataatgatgtaaggccaggcaggaaaacaaaatatttggagctgtttggtcttgcctgtcgtactaccaaggaaagatagggccggaaaagcaaacccaaacaattcctttttttatgaaatagctccagatgatacccttcccctgcaccccatcttcacactaa

6、seq id no:2与seq id no:1区别在于，在第201为碱基为t。

7、一种与母猪畸形仔猪数相关的snp分子标记在以下至少一种中的应用：

8、(1)筛选和培育畸形仔猪数少的母猪中的应用；

9、(2)在鉴定畸形仔猪数少的母猪中的应用；

10、(3)在检测所述snp分子标记得基因型中的应用。

11、本发明的有益效果：

12、本发明确定了与母猪畸形仔猪数相关的分子遗传标记，即11.1版本国际猪基因组6号染色体上的从5’端起的第26270268位点的核苷酸，对应于enssscg00000054374基因下游的第43530位点的核苷酸，该位点的碱基为g或t。为猪的繁殖性能改良提供了一种全新的方法，有助于提升养猪业的整体经济效益和遗传改良的科学性。

1.一种与母猪畸形仔猪数相关的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no:1或2所示。

2.权利要求1所述的snp分子标记在以下至少一种的应用，其特征在于，所述应用为：