一种鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的生物标志物及其应用

本发明涉及生物，特别是涉及一种鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的生物标志物及其应用。

背景技术：

1、棉花作为最重要的油料作物之一，其包含的棉籽油占整个种子重量的约20％，是棉花中仅次于纤维的第二大有价值的组分，表明棉籽油是一种具有发展潜力的重要农产品。

2、棉花在我国广泛种植，棉籽油作为棉花的副产品，相比于其他油料作物，棉籽油富含丰富的亚油酸，对于治疗心血管疾病具有重要的作用；此外棉籽油也是一种优秀的煎炸食品用油和生物柴油的原材料。

3、目前棉花研究以纤维品质和产量为主，对棉籽油的重视程度不足，这可能是导致棉籽油产量呈现波动趋势的主要原因。因此加速高油棉花品种的选育，有利于提高我国油料自给率，保障我国油料安全，突破种业“卡脖子”难题。

技术实现思路

1、本发明的目的是提供一种鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的生物标志物及其应用，以解决上述现有技术存在的问题。采用本发明提供的生物标志物可以有效鉴别高棉籽油含量陆地棉品种，本发明为推动棉籽油的遗传育种，加快培育棉花高油品种提供了遗传机制基础，对进一步提高棉籽利用价值具有深远的意义。

2、为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

3、本发明提供一种鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的生物标志物，所述生物标志物为ghir_d03g013530基因、ghir_d03g013680基因和ghir_d12g004870基因；

4、所述ghir_d03g013530基因的cds序列如seq id no.1所示；

5、所述ghir_d03g013680基因的cds序列如seq id no.2所示；

6、所述ghir_d12g004870基因的cds序列如seq id no.3所示。

7、本发明还提供一种检测上述的生物标志物的引物对，当所述生物标志物为所述ghir_d03g013530基因时，所述引物对包括核苷酸序列如seq id no.4所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no.5所示的下游引物；

8、当所述生物标志物为所述ghir_d03g013680基因时，所述引物对包括核苷酸序列如seq id no.6所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no.7所示的下游引物；

9、当所述生物标志物为所述ghir_d12g004870基因时，所述引物对包括核苷酸序列如seq id no.8所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no.9所示的下游引物。

10、本发明还提供检测上述的生物标志物表达量的试剂在制备鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的检测产品中的应用。

11、进一步地，所述检测产品为试剂盒。

12、进一步地，所述试剂为上述的引物对。

13、本发明还提供一种鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的检测产品，包括检测上述的生物标志物表达量的试剂。

14、进一步地，所述检测产品为试剂盒。

15、进一步地，所述试剂为上述的引物对。

16、本发明还提供上述的生物标志物、引物对或检测产品在鉴别高棉籽油含量陆地棉品种中的应用。

17、本发明还提供一种鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的方法，包括对上述的生物标志物在待检陆地棉样品中的表达量进行检测，根据表达量检测结果鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的步骤；

18、当所述生物标志物为所述ghir_d03g013530基因时，所述ghir_d03g013530基因的表达量越低，提示所述待检陆地棉样品的棉籽油含量越高；

19、当所述生物标志物为所述ghir_d03g013680基因时，所述ghir_d03g013680基因的表达量越低，提示所述待检陆地棉样品的棉籽油含量越高；

20、当所述生物标志物为所述ghir_d12g004870基因时，所述ghir_d12g004870基因的表达量越高，提示所述待检陆地棉样品的棉籽油含量越高。

21、本发明公开了以下技术效果：

22、本发明根据全基因组关联分析、单倍型分析、表型变异分析、转录组表达水平分析和基因注释。共鉴定到三个参与油脂代谢的候选基因，分别是ghir_d03g013530(ghhad)、ghir_d03g013680(ghtpi)和ghir_d12g004870(ghran1)，并通过qrt-pcr分析对基因功能进行了初步验证。结果发现，ghir_d03g013530可能通过抑制aba响应和水解pa降低棉籽含油量，ghir_d03g013680可能通过催化dhap和gap之间相互转化，减少g-3-p的底物，来限制tag组装。qrt-pcr分析表明上述两个基因均在低油品种中表达水平更高，与本发明分析结果一致。ghir_d12g004870可能通过激活乙烯应答，抑制aapt的表达，增加pc向dag转化，qrt-pcr分析表明该基因在高油品种中表达水平更高，说明该基因的表达可以促进棉籽油的合成。

23、本发明为推动棉籽油的遗传育种，加快培育棉花高油品种提供了遗传机制基础，对进一步提高棉籽利用价值具有深远的意义。

1.一种鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物为ghir_d03g013530基因、ghir_d03g013680基因和ghir_d12g004870基因；

2.一种检测权利要求1所述的生物标志物的引物对，其特征在于，当所述生物标志物为所述ghir_d03g013530基因时，所述引物对包括核苷酸序列如seq id no.4所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no.5所示的下游引物；

3.检测权利要求1所述的生物标志物表达量的试剂在制备鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的检测产品中的应用。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述检测产品为试剂盒。

5.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂为权利要求2所述的引物对。

6.一种鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的检测产品，其特征在于，包括检测权利要求1所述的生物标志物表达量的试剂。

7.根据权利要求6所述的检测产品，其特征在于，所述检测产品为试剂盒。

8.根据权利要求6所述的检测产品，其特征在于，所述试剂为权利要求2所述的引物对。

9.一种如权利要求1所述的生物标志物、权利要求2所述的引物对或权利要求6-8任一项所述的检测产品在鉴别高棉籽油含量陆地棉品种中的应用。

10.一种鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的方法，其特征在于，包括对权利要求1所述的生物标志物在待检陆地棉样品中的表达量进行检测，根据表达量检测结果鉴别高棉籽油含量陆地棉品种的步骤；