长新冠分型的生物标志物组及其应用、分型产品及分型方法

本公开涉及长新冠分型,具体而言,涉及一种长新冠分型的生物标志物组及其应用、长新冠分型产品及分型方法。
背景技术:
1、根据世界卫生组织定义,长新冠指在新冠病毒感染3个月后继续或出现新的症状,包括疲劳、呼吸短促和认知功能障碍等,并且持续至少2个月。据调查,长新冠的发病率在1.9%到20%不等,截至2024年4月,全球累计向世界卫生组织汇报了近8亿例新冠病毒感染病例,保守估计全球至少有数千万人经历过长新冠。长新冠是一种多表现形式的疾病,可累及机体呼吸、神经、循环等多个系统,据统计长新冠症状多达200多种。
2、庞大的长新冠患者基数对社会和医疗卫生系统造成了巨大的负担,缓解和治疗长新冠患者的第一步是正确地诊断长新冠,然而目前还没有可用于长新冠的特异诊断方法。临床医生可能通过血化验、心电图、影像学检查、心理评估等多种手段综合评估长新冠患者的机体状态以寻找可能存在的病因,然而长新冠患者常规的检测结果通常在正常范围之内,且异常的检查结果未必和长新冠症状相关。同时目前研究发现不同系统的长新冠之间发生机制可能并不相同,而常规的辅助检查并不能有效区分和诊断不同的亚型长新冠。
3、需要说明的是,在上述背景技术部分公开的信息仅用于加强对本公开的背景的理解,因此可以包括不构成对本领域普通技术人员已知的现有技术的信息。
技术实现思路
1、本公开的目的在于克服上述现有技术的不足,提供一种长新冠分型的生物标志物组及其应用、分型产品及分型方法,通过待测样本的对应的生物标志物检测结果,实现待测样本的长新冠分型。
2、根据本公开的一个方面,提供一种长新冠分型的生物标志物组,所述生物标志物组包括:
3、第一生物标志物亚组的生物标志物fpgt,amdhd2中的至少一个;
4、第二生物标志物亚组的生物标志物psme4,tsc2,cbx6,acacb中的至少一个;
5、第三生物标志物亚组的生物标志物hnrnpul1,dgkh中的至少一个;
6、第四生物标志物亚组的生物标志物ddx20,rbbp4,pcna中的至少一个;
7、和,第五生物标志物亚组的生物标志物cdk11b,crh,lpcat2中的至少一个。
8、在本公开的一种示例性实施例中,所述生物标志物组包括amdhd2蛋白、acacb蛋白、dgkh蛋白、ddx20蛋白和cdk11b蛋白。
9、在本公开的一种示例性实施例中,所述生物标志物组包括amdhd2蛋白的mrna、acacb蛋白的mrna、dgkh蛋白的mrna、ddx20蛋白的mrna和cdk11b蛋白的mrna。
10、在本公开的一种示例性实施例中,所述生物标志物组包括fpgt蛋白、cbx6蛋白、dgkh蛋白、rbbp4蛋白和crh蛋白。
11、在本公开的一种示例性实施例中,所述生物标志物组包括fpgt蛋白的mrna、cbx6蛋白的mrna、dgkh蛋白的mrna、rbbp4蛋白的mrna和crh蛋白的mrna。
12、根据本公开的另一个方面,提供一种上述生物标志物组在制备长新冠分型产品中的应用。
13、根据本公开的另一个方面,提供一种长新冠分型产品,该产品包括用于检测上述的生物标志物组中各个生物标志物的试剂。
14、在本公开的一种示例性实施例中,所述产品为试剂盒,检测试剂或生物芯片。
15、根据本公开的另一个方面,提供一种长新冠分型方法,该方法包括以下步骤:
16、s1、获得待测样本,所述待测样本取自长新冠患者;
17、s2、采用上述的长新冠分型产品,检测待测样本中第一生物标志物、第二生物标志物、第三生物标志物、第四生物标志物、第五生物标志物的蛋白表达水平,获得待测样本的蛋白表达结果;
18、其中,第一生物标志物选自第一生物标志物亚组中的至少一个生物标志物;第二生物标志物选自第二生物标志物亚组中的至少一个生物标志物;第三生物标志物选自第三生物标志物亚组中的至少一个生物标志物;第四生物标志物选自第四生物标志物亚组中的至少一个生物标志物;第五生物标志物选自第五生物标志物亚组中的至少一个生物标志物;
19、s3、将步骤s2获得的待测样本的蛋白表达结果输入长新冠多元神经网络语言诊断模型,获得长新冠多元神经网络语言诊断模型的输出结果;
20、若输出结果为第一生物标志物,则待测样本为神经系统型;若输出结果为第二生物标志物,则待测样本为心血管系统和神经系统复合型;若输出结果为第三生物标志物,则待测样本为骨骼肌系统和全身非特异性系统复合型;若输出结果为第四生物标志物,则待测样本为心血管系统和呼吸系统复合型;若输出结果为第五生物标志物,则待测样本为多系统复合型,所述多系统复合型包括神经系统、血液循环系统、呼吸系统、骨骼肌系统、全身非特异性系统中的至少四个系统的复合型。
21、在本公开的一种示例性实施例中,所述长新冠分型方法包括以下步骤:
22、s1、获得待测样本,所述待测样本取自长新冠患者;
23、s2、采用上述的长新冠分型产品,检测待测样本中amdhd2蛋白、acacb蛋白、dgkh蛋白、ddx20蛋白和cdk11b蛋白的表达水平,获得待测样本的蛋白表达结果;
24、s3、将步骤s2获得的待测样本的蛋白表达结果输入长新冠多元神经网络语言诊断模型,获得长新冠多元神经网络语言诊断模型的输出结果;若输出结果为amdhd2蛋白,则待测样本为神经系统型;若输出结果为acacb蛋白,则待测样本为心血管系统和神经系统复合型;若输出结果为ddx20蛋白,则待测样本为心血管系统和呼吸系统复合型;若输出结果为dgkh蛋白,则待测样本为骨骼肌系统和全身非特异性系统复合型;若输出结果为cdk11b蛋白,则待测样本为多系统复合型。
25、在本公开的一种示例性实施例中,所述长新冠分型方法包括以下步骤:
26、s1、获得待测样本,所述待测样本取自长新冠患者;
27、s2、采用上述的长新冠分型产品,检测待测样本中fpgt蛋白、cbx6蛋白、dgkh蛋白、rbbp4蛋白和crh蛋白的表达水平,获得待测样本的蛋白表达结果;
28、s3、将步骤s2获得的待测样本的蛋白表达结果输入长新冠多元神经网络语言诊断模型,获得长新冠多元神经网络语言诊断模型的输出结果;若输出结果为fpgt蛋白,则待测样本为神经系统型;若输出结果为cbx6蛋白,则待测样本为心血管系统和神经系统复合型;若输出结果为rbbp4蛋白,则待测样本为心血管系统和呼吸系统复合型;若输出结果为dgkh蛋白,则待测样本为骨骼肌系统和全身非特异性系统复合型;若输出结果为crh蛋白,则待测样本为多系统复合型。
29、在本公开的一种示例性实施例中,步骤s3中的长新冠多元神经网络语言诊断模型的构建过程为:
30、获取长新冠受试者的样本,将长新冠受试者分为五个实验组,所述实验组包括:心血管系统和呼吸系统复合型长新冠组,心血管系统和神经系统复合型长新冠组,神经系统型长新冠组,骨骼肌系统和全身非特异性系统复合型长新冠组,多系统复合型长新冠组;
31、获取各实验组中的各个样本的第一生物标志物、第二生物标志物、第三生物标志物、第四生物标志物和第五生物标志物的蛋白表达水平;各实验组中的各个样本的第一生物标志物、第二生物标志物、第三生物标志物、第四生物标志物和第五生物标志物的蛋白表达水平构成数据集;
32、随机抽取数据集中的70%~80%的数据作为训练集,将训练集输入多元神经网络语言诊断模型进行迭代训练,获得长新冠多元神经网络语言诊断模型。
33、本公开提供的生物标志物组具有高灵敏度和特异性,可以准确的检测长新冠的分型,以提高长新冠分型筛查的准确性;同时,便于对不同分型的长新冠进行针对性的干预。
34、应当理解的是,以上的一般描述和后文的细节描述仅是示例性和解释性的,并不能限制本公开。
技术研发人员:张文宏,艾静文,郭晶鑫,王森,林可,张昊澄,蔡健鹏
技术所有人:复旦大学附属华山医院
备 注:该技术已申请专利,仅供学习研究,如用于商业用途,请联系技术所有人。
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