一种鉴定番茄种子颜色的SNP位点、KASP标记引物组及其应用

1.一种鉴定番茄种子颜色的snp位点，其特征在于，所述snp位点位于seq id no：1第501bp处，多态性为t/c。

2.根据权利要求1所述的一种鉴定番茄种子颜色的snp位点，其特征在于，当snp位点的碱基为t时，该番茄种子颜色为灰黄色；当碱基为c时，该番茄种子颜色为深褐色。

3.一组kasp分子标记引物组，其特征在于，针对权利要求1所述的snp位点；包括f1引物如seq id no：2所示，f2引物如seq id no：3所示，c引物如seq id no：4所示。

4.根据权利要求3所述的kasp分子标记引物组，其特征在于，所述f1引物5’端带有荧光修饰基团fam，所述f2引物5’端带有荧光修饰基团hex。

5.如权利要求1或2所述的snp位点或权利要求3或4所述的kasp分子标记引物组在下列(1)～(5)中任一项的应用：

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，番茄深褐色种子的株系自交后种子为深褐色，而深褐色种子株系做母本与正常野生型灰黄色种子株系杂交后的种子为灰黄色，呈当代显性特征。

7.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，深褐色种子的番茄可用于种子杂交繁殖后杂交种纯度的鉴定、假杂种的筛除以及杂交种纯度的提升。

8.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述应用包括以下步骤：

9.根据权利要求8所述的应用，其特征在于，所述步骤c中，褐色种子显示绿色荧光信号，纯合基因灰黄色种子显示蓝色荧光信号，杂合基因型灰黄色种子显示红色荧光信号。