用于产生具有单链粘端的双链DNA片段的异源双链体热稳定性连接组装(HTLA)和/或环状异源双链体热稳定性连接组装(CHTLA)
技术特征:
1.一种形成具有5'或3'突出端的粘端块(seb)的方法,所述方法包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述缓冲介质的ph为约6.0至约9。
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述缓冲介质包含tris-hcl、mgcl2、kcl、nad、dtt和triton x-100。
4.根据权利要求1所述的方法,其中用于熔融的温度由所述序列的大小决定并且在约37℃至100℃的范围内。
5.根据权利要求1所述的方法,其中用于熔融的加热时间段在30秒至10分钟的范围内。
6.根据权利要求1所述的方法,其中退火在比所述熔融温度低5℃至40℃的温度下进行。
7.根据权利要求1所述的方法,其中用于退火的时间段为约4分钟至10分钟。
8.根据权利要求1所述的方法,其中前体dna片段的大小为长度在约20个核苷酸至数千个核苷酸的范围内,并且可以是单链或双链的。
9.根据权利要求1所述的方法,其中所述缓冲介质包含tris-hcl、mgcl2、kcl、nad、dtt和triton x-100,ph为约7.5至约8,其中熔融温度高于约80℃,持续约3分钟,其中退火温度比所述熔融温度低约10℃至20℃并且持续约4分钟至6分钟,其中熔融、退火和连接的步骤在2次至12次的范围内进行多次以产生钝端产物。
10.根据权利要求1所述的方法,其中熔融、退火和连接的步骤在2次至30次的范围内进行多次以产生粘端产物。
11.根据权利要求9所述的方法,其中所述粘端序列可以用t4连接酶连接,以得到更长的延伸序列。
12.根据权利要求9所述的方法,其中前体dna片段的大小为长度在约20个核苷酸至数千个核苷酸的范围内,并且可以是单链或双链的。
13.根据权利要求9所述的方法,其中与熔融、退火和连接相关的温度在约95℃至约60℃的较低温度的范围内,持续一个、两个、三个或更多个循环。
14.根据权利要求1所述的方法,其中所定义的dna序列包含一个或多个随机或可变核苷酸。
15.一种形成粘端异源双链体dna与钝端dna产物的混合物的方法,所述方法包括:
16.根据权利要求15所述的方法,其中通过使用能够连接粘端并形成延伸核苷酸序列和/或环状dna的dna连接酶进一步连接粘端互补dna序列。
技术总结
本发明涉及一种在以双链为主的DNA分子中产生具有使用者定义的长度和序列的单链突出端(粘端)的方法,其中所述方法与限制性核酸内切酶和DNA核酸外切酶活性无关,并且其中所形成的异源双链体DNA是使用DNA连接酶通过一次或多次连接来接合的,最终结果为产生具有单链突出端的双链DNA片段,以用于接合和产生具有可变区选择的更大的线性或共价闭合环状DNA分子。
技术研发人员:查尔斯·J·比耶贝里希,李祥
受保护的技术使用者:马里兰大学巴尔的摩县
技术研发日:
技术公布日:2024/11/21
技术研发人员:查尔斯·J·比耶贝里希,李祥
技术所有人:马里兰大学巴尔的摩县
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